1871’de Sarakusta’da doğdu, Cizvit okulunda Latince ve Matematik eğitimi aldı. Zaragoza Üniversitesi’nde Edebiyat Fakültesi’nde okudu ve mezuniyetinde papaz oldu. Bu süreçte Arap Dili ve Edebiyatı Profesörü Julián Ribera y Tarrago’yla tanıştı ve himayesine girdi. İspanya’daki İslâm mirası üzerine arşivlerde çalıştı. Doktorasını Gazali üzerine yaptı (Algazel, dogmática, moral, y ascética – 1901). 1903’te Madrid Üniversitesi’ne öğretim görevlisi tayin edildi. İslâm ve Batı felsefesi arasındaki etkileşimlere odaklandığı makaleleri bu dönemde büyük yankı uyandırmıştır. İspanya Kraliyet Akademisi’ne üye seçildi. Kendisine asıl ününü sağlayan La escatologia Musulmána en la Divina Comedia (İlâhî Komedya’da İslâm Uhreviyatı) adlı eserini 1919’da yayınladı. 1933’te Escuela de Estudios Árabes’ın çıkardığı al-Andalus dergisinin editörü oldu. Son yıllarını Arapça gramer ve sözlük hazırlığına hasreden Palacios 1944’te vefat etmiştir.
